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土壤RNA纯化试剂盒(过柱法)

Source:狄光辉Author:admin Addtime:2023/05/04 Click:
由于土壤中有机质含量丰富,尤其是其中的腐殖酸对RT-PCR等后续反应有极大的抑制作用,所以从土壤微生物提取高纯度的 RNA一直是十分棘手的问题。本产品具有下列特点:
1. 处理一个样品只需要约十几分钟。
2. 去污染效果好,RNA纯度更高,平均 OD260/280一般都在2.0左右。
3. 得到的RNA可直接用于 RT-PCR、Northern 杂交、cDNA 合成等实验。
4. 性价比高于进口的土壤 RNA 提取产品。
5. 试剂无毒无害, 环保。
6. 可以进行无氯仿操作,只是纯度稍微降低,但不影响使用。
本产品只能用于科研。

1. 称取 0.1-0.5 g 的土壤,加入 1 mL 土壤RNA纯化溶液A,震荡器上剧烈震荡 5-10分钟。注意:一定要让管底的土壤震荡起来。注意:溶解土壤RNA纯化溶液A沉淀。土壤RNA纯化溶液A在 4℃放置后可能会产生沉淀,使用前必须放在 65℃水浴使沉淀彻底溶解并充分摇匀后再取用。
2. 稍微静置后将上清液转移至一个干净的 1.5  mL 塑料离心管中。
3. 在离心管中加入 0.3 mL 的溶液B 和 0.2 mL 自备氯仿,在振荡器上振荡 30 秒混匀。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。
4. 室温 12000 rpm 离心 3-5 分钟。
5. 将上清液(约 0.6 mL)转移到另一干净的 1.5 mL 塑料离心管中,下层有机相和中间层含有DNA、蛋白质和其他杂质,避免触及或吸取。最好留下 100 μL 上清液不取。
6. 在上清液中加入 0.5 mL 的溶液 C 和 0.2 mL 的自备氯仿,用手上下颠倒或振荡器振荡 30 秒混匀,此时溶液呈均匀的乳浊状。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。
7. 室温 12000 rpm 离心 3 分钟,两相间将有白色膜状物(蛋白质)形成。
8. 将上清液(约 1 mL)转移到另一干净的 1.5 mL 塑料离心管中,避免触及或吸取有机相及其上面的白色膜状物。
9. 在上清液中加入 0.5 倍体积的溶液D,用手上下颠倒或振荡器振荡 30 秒混匀,此时溶液呈白色浑浊状。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。
10. 将一半的溶液转移到离心吸附柱中,套入收集管中厚 12000 rpm 室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
11. 将剩下的一半溶液转移到同一离心吸附柱中, 套入收集管中后 12000 rpm 室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
12. 加 0.5  mL 洗柱液,套入收集管中后室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
13. 加 0.5mL 洗柱液,套入收集管中后室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。此步可以省略。
14. 将离心吸附柱套入收集管中后室温离心半分钟,弃含穿透液的收集管。 15 可选步骤:(膜上消化 DNA)
15. 将 5Ul 的 RNase-free DNase 加入到 45ul DNase buffer 中混匀,加入到离心吸附柱中,室温放置 5-15 分钟(如果后续电泳检测DNA 污染没消化干净,可加大 DNase 的用量和室温放置时间延长)。
16. 直接在离心吸附柱中加 0.5ml 的去酶液,盖上盖后颠倒混匀。
17. 室温 12000 g 离心 1 分钟,弃穿透液。
18. 再加 0.5ml 的去酶液,12000 g 室温离心 1 分钟,弃穿透液。
19. 室温 12000 g 离心 2 分钟,此步非常重要,否则残留的乙醇会影响 RNA 的使用。
20. 将离心吸附柱套入到一个自备的 RNase-free 收集管中,加入 30-100 μL RNA 洗脱液,室温放置 1-2 分钟。
12000 rpm 室温离心半分钟,离心管中溶液即为 RNA 样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。