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粪便基因组DNA提取粪便的处理方法

Source:狄光辉Author:admin Addtime:2018/06/28 Click:
粪便基因组DNA提取过程一般是对肠道菌群的一个综合性分析的一个实验,所以粪便基因组DNA的提取是对肠道微生物分离提取的过程。

由于粪便,在我们看来是污秽之物,所以提取就显得和别的不一样。实际上不是的,提取过程和方法还是一样的。你就想象是在一个复杂样本中提取微生物的DNA.

1.第一种方法,分离微生物,然后对粪便进行菌种的筛选,扩大培养,然后对扩大后的菌体离心,加裂解液,用离心柱子或者醇沉淀,或者磁珠提取都可以

2.第二种方法,不分离,粪便研磨(最好液氮研磨),加裂解液,然后离心取上清,实际上DNA已经全部在上清里面了,然后再进行结合,洗涤洗脱就可以





注意事项:
 
1、新鲜的粪便样本会得到更高的产率,不同样本在采样前应先查阅相应的最佳保存条件。 
 
2、若溶液中出现浑浊可在 37℃水浴中溶解片刻至清澈,不会影响结果。 
 
3、在需要吸取上清液的步骤中应避免吸到沉淀,否则会堵塞吸附柱,并影响产物纯度。
 
4、洗脱缓冲液的体积最好不少于 50ul ,体积过小会影响回收效率;建议使用试剂盒附带的洗脱缓冲液,用水洗脱也会损失部分产物;DNA 应保存在-20 ℃避免反复冻融,以防降解。 
 
5、 液体试剂避免接触皮肤,若意外接触应立即使用大量清水冲洗。


狄光辉 13683842418 QQ:625006192